San Pelayo está ubicado en Merindad de Montija municipio en la provincia de Provincia de Burgos, Castilla y León. La población de San Pelayo es de 13 personas (2020), la distancia de San Pelayo a Madrid es de 347 kilómetros, la distancia de San Pelayo a Burgos (capital de la Provincia de Burgos) es de 96 kilómetros. Villasante, Quintanilla Sopeña, Loma de Montija, Noceco, Bercedo, Hedesa, Villalázara, Montecillo de Montija, Agüera y Barcenillas del Rivero se encuentran cerca de San Pelayo.
